Не поленился, откопал таки тот самый сериал. И мотивацию Шреддера свели до "Я следил за ним, припёрся чтобы мстить в Америку. И мутаген на черепах тоже я пролил, муахахах какой я злобный Ороку Саки"

Ну, типа. Извечная проблема всего, начинающегося с комиксов - из-за перехода прав между издателями и студиями туда-сюда возникает мешанина "где что было и где что канон")
Таки да, в старом сериале чутка адаптировали комикс для детского восприятия, похоже (комикс - с 1984-го, а сериал - 1987-го, и, вроде как, была какая-то первая экранизация, где Сплинтер - ручной крыс Йоши, а не сам Йоши, но вики ничего путного по названию этой экранизации сказать не может).
А, сорри, немного вру, это в комиксах раскрывается. В сериале действительно ограничились "Саки завидовал Йоши и подставил его перед сенсеем", а Шреддер припёрся в США, потому что спутался с Крэнгом, меа кульпа.
Емнип, узнал, что Йоши\Сплинтер выжил и припёрся мстить. У Шреддера был старший брат, который положил глаз на жену Сплинтера (тогда - Йоши), во время покушения на Йоши брательник погиб, Шреддер же, по классике жанра, поклялся отомстить за бротюню. Ну и дальше уже то, что ты упомянул, подставил Сплинтера, того выпизднули из клана, а Шреддер дослужился до высоких рангов.